《三国群英传3》相比前作新增了不少内容，首先，内政方式采用新的回合制，依照君主的势力大小而有不同的下指令数目，表面上虽然指令数减少，但是原本只能每年做一次内政事务，现在则改为每个月都可以下指令，因此会有更充裕时间来统一全中国，发动战争也将并入到内政模式中，可以让玩家考虑的更清楚，不会有多线作战的烦恼。

　　在前两代中，战争时双方军队都是排列成两排然后一对一对的进入战斗，这种玩法虽然十分简单易懂，不过很难表现出真正历史战争中的地形因素，像江东的孙权主要就是依靠着长江的天险和北方的曹操僵持数十年，现在游戏中的50多个城池及十多个重要据点，都有各式不同的地形，在南方由于长江及支流面积广阔，最好派上擅长水战的将领来作战才会有利。