《伊苏：起源》承袭前两作的3D画面、2D平面滚动条玩法，玩家可操作主角纵横于各种不同的迷宫关卡中，以灵活多样化的移动、跳跃与攻击方式，来与众多敌人以及巨大的头目级角色战斗。

　　有别于以往系列作皆以红发传奇冒险家亚特尔（Adol）为主角的传统，本作将时空背景回溯到《伊苏》初代作700年前之古伊苏王国末期艾斯特利亚地方，并采双主角制，由擅长肉搏战的见习女骑士优妮卡‧托瓦（Yunika Tovah）与擅长魔法攻击的天才男魔道师雨果‧法克特（Hugo Fukt）担任主角。