《光荣使命2：破碎棱镜》设定在乌克兰危机之中的当下时局：乌克兰坠机事件导致地区紧张局势升级，美国在乌克兰部署反导系统，日本宣布拥有核武器并冻结俄罗斯全部在日资产。中俄两国以大规模联合军演回应，演习基地突然遭到不明武装力量袭击，主角随特种部队搭乘IL-76运输机紧急升空执行任务。