在进行主线任务“内贼”时，扫描学院的电脑网路后，此时没有回头路，聆听广播里传来的声音。主角只好走进前面的电梯，随之缓缓降落，目睹一个地下城市，称为学院的科技实验基地。
来到居住区，看到房间里坐着一个叫尚恩的小男孩，主角以为是自己的孩子，上前相认。但小男孩呼叫着爸爸，随后出现一名自称是父亲的人向你解释这一切。
原来这个小男孩是利用学院科技合成出来的，而老者才是主角的儿子尚恩。主角在冰柜里冰封了六十年，而当年襁褓中的尚恩如今已是学院的领袖，白发苍苍的老者。
当年学院的人找到还是婴儿的他，认为他的细胞没有受到辐射污染，于是使用他的基因样本来合成有机物，创造出学院中的每个合成年人。因此，尚恩被学院的人称为父亲大人。
后来尚恩接管了学院，并释放了避难所里的主角，没想到今天亲人能够团聚于此。他向你发出邀请，建议加入。此时加入学院不会对其他路线产生冲突，反而有助于完成其他路线的任务，比如钢铁兄弟会的“来自内部”，还有铁路路线的任务也需要学院任务的推动解锁。
接下来熟悉学院，要前去会现四名部门主管。乘电梯来到庭院，切换到本地地图，可以看到四名主管的位置，按照那个方向进到对应的建筑就可以了。
艾莉•菲尔摩是学院的首席工程师，她负责维护学院的机械和电子系统。
麦蒂森•黎博士交给主角一块追猎者晶片，用它可获得完全的通行权限，可以任意传送进出学院。
贾斯汀•艾尔是合成年人回收部门代理部长。回收部门致力于派出追猎者，追捕逃走的合成年人。他对主角并不是很信任，说学院一向不接受外来者的，主角完全是靠着和院长的血亲关系。
克雷顿是生命科学部门的部长。他致力于培育特殊的花卉和植物，来调节学院人们的身体健康。
还记得维吉尔的委托吗?他的血清就在生命科学部，如果你的骇客技能够高现在就能搞到手。
在这个种菜的大厅一侧有道影壁墙，拥有大师级骇客技能就可以破解这个终端，解除光栅。
进到FEV实验室，来到有很多变种人容器的地方，左转桌子上的仪器里取得实验血清。
前往发光海的岩洞见维吉尔，将血清交给他，过几天再回来验证效果。
再次见到维吉尔，发现他已恢复到正常人类形态，他很高兴的感谢主角，并让主角随便使用这间实验室和这里的东西。
旁边的大箱子里有战斗胸甲，桌子上还有本《特斯拉科学》（能量武器造成的爆击伤害+5%）。
书归正传。见过四位主管后，回到居所和尚恩谈话，他说学院的校训是：重新定义人类。合成年人身心超乎寻常，若是拥有自由意识则后患无穷。
本任务完成，解锁学院路线任务“合成年人拘留”。