本二周目图文攻略以精灵宝可梦火红版为基础制作，叶绿版本也完全可以使用，除过部分宝可梦有所不同外剧情什么都是一样的，虽然国内玩家喜欢了叫口袋妖怪火红叶绿或者神奇宝贝火红叶绿。
番外篇第一章 七岛之旅
二周目一开始博士就来找你，如果图鉴收服超过60，大木博士会帮你升级至全国图鉴模式
再去挑战四天王，科拿旅游去了！于是主角也放松心情，来个海岛旅行
在一之岛遇到之前的阿棉，得知要修好机器需要宝石
再次来到灯火山，往右边走遇到两个火箭队余党，听到第一个密码的情报，顺便解决他们
在洞内找到红宝石，拿回去交给阿棉，得知和红宝石相对应的另一块宝石，得到彩虹通行证，可以穿梭七岛之间
坐船来到四之岛，遇到小茂，奇怪的是居然不开战
宝可梦饲育屋，可以繁殖后代
此处可学到泰山压顶
居然是科拿的家，难道她回娘家了
在科拿家后方发现一个洞窟
从这里掉下去，上梯子，从右下角掉下去
捡到HM07鱼跃龙门
现在可以登上门口的瀑布了
在洞内深处发现科拿与火箭队，打败他们后得知被抓住的宝可梦关在五之岛的仓库里，GO
来到五之岛，先往左边的水之迷宫
从老者处获得波克比蛋（条件：首位宝可梦亲密度高及身上有空位）
从水之迷宫向上冲浪来到高级度假村，就一间房子，什么都没有
度假村右边有个不归洞穴（恐怖的名字）
走法：右边，下面
走法：右边，上面，下面，上面
走法：右边，上面，下面，下面，右边，右边
走法：右边，上面，下面，下面，右边，左边，下面，左边
走法：右边，上面，下面，下面，右边，左边，下面，右边，上面
KO两只猫老大之后把秋穗小姐带回家
再走一次秋穗小姐所在地得到丝绸围巾
回五之岛，向右边来到空地，再向下来到仓库，不过需要密码
先到回忆之塔逛逛，看到个大岩蛇之墓（壮观啊）
既然不知道密码就先来六之岛，在中心再次遇到小茂(以前见面就打，现在怎么斯文了）
右边冲浪来到水之小径，下面通往遗迹山谷
通过水之小径来到绿色小径，进入记号森林
森林里除了诸多训练家，还能遇到赫拉克罗斯
穿过森林，来到绿色小径另一头，冲浪到尽头有一个洞窟
虽然说是变化洞窟，不过在没有刷卡器的情况下就只有超音蝠一种宝可梦
回到六之岛向下来到这里，使用一字斩门就开了
内部结构跟不归洞穴有点类似
走法：上面，左边，右边，下面
落到最底层取得蓝宝石，但是马上被强盗抢走，同时得知第二个密码，现在可以去火箭队仓库了
回到五之岛输入密码进入仓库
在内部找到现任火箭队老大，KO他，再次解散火箭队！同时从强盗手上抢回蓝宝石
将宝石交给阿棉凑成一对，终于可以跟宝石版通信了
接下来征服最后一个小岛吧
七之岛的上方是训练师之塔，可以锻炼自己的战斗水平和技巧
向下是溪谷入口，继续前进到七宝溪谷
谷中发现一处机关山洞
将七个洞穴填平，似乎触动了某处的机关
出洞继续向下，这里稍作休息，下面就是阿斯卡纳遗迹了
遗迹一共有七处，每个石室里都只有未知图腾
终于环游七岛结束了，回关都吧
来到华蓝市，图中洞穴看守人不见了，冲浪过去到华蓝洞（阴森啊）
从这里上去之后走下面的路直通（记住直通， 不要碎石走岔路）到楼梯口，下去
看到超梦没，绕路过去欺负它
大师球别舍不得用了，扔吧
番外篇第二章 石英再论剑
再次去挑战冠军联盟，天王门实力大增
科拿：
希巴：
菊子：
渡：
小茂：
番外篇第一章 七岛之旅
二周目一开始博士就来找你，如果图鉴收服超过60，大木博士会帮你升级至全国图鉴模式
再去挑战四天王，科拿旅游去了！于是主角也放松心情，来个海岛旅行
在一之岛遇到之前的阿棉，得知要修好机器需要宝石
再次来到灯火山，往右边走遇到两个火箭队余党，听到第一个密码的情报，顺便解决他们
在洞内找到红宝石，拿回去交给阿棉，得知和红宝石相对应的另一块宝石，得到彩虹通行证，可以穿梭七岛之间
坐船来到四之岛，遇到小茂，奇怪的是居然不开战
宝可梦饲育屋，可以繁殖后代
此处可学到泰山压顶
居然是科拿的家，难道她回娘家了
在科拿家后方发现一个洞窟
从这里掉下去，上梯子，从右下角掉下去
捡到HM07鱼跃龙门
现在可以登上门口的瀑布了
在洞内深处发现科拿与火箭队，打败他们后得知被抓住的宝可梦关在五之岛的仓库里，GO
来到五之岛，先往左边的水之迷宫
从老者处获得波克比蛋（条件：首位宝可梦亲密度高及身上有空位）
从水之迷宫向上冲浪来到高级度假村，就一间房子，什么都没有
度假村右边有个不归洞穴（恐怖的名字）
走法：右边，下面
走法：右边，上面，下面，上面
走法：右边，上面，下面，下面，右边，右边
走法：右边，上面，下面，下面，右边，左边，下面，左边
走法：右边，上面，下面，下面，右边，左边，下面，右边，上面
KO两只猫老大之后把秋穗小姐带回家
再走一次秋穗小姐所在地得到丝绸围巾
回五之岛，向右边来到空地，再向下来到仓库，不过需要密码
先到回忆之塔逛逛，看到个大岩蛇之墓（壮观啊）
既然不知道密码就先来六之岛，在中心再次遇到小茂(以前见面就打，现在怎么斯文了）
右边冲浪来到水之小径，下面通往遗迹山谷
通过水之小径来到绿色小径，进入记号森林
森林里除了诸多训练家，还能遇到赫拉克罗斯
穿过森林，来到绿色小径另一头，冲浪到尽头有一个洞窟
虽然说是变化洞窟，不过在没有刷卡器的情况下就只有超音蝠一种宝可梦
回到六之岛向下来到这里，使用一字斩门就开了
内部结构跟不归洞穴有点类似
走法：上面，左边，右边，下面
落到最底层取得蓝宝石，但是马上被强盗抢走，同时得知第二个密码，现在可以去火箭队仓库了
回到五之岛输入密码进入仓库
在内部找到现任火箭队老大，KO他，再次解散火箭队！同时从强盗手上抢回蓝宝石
将宝石交给阿棉凑成一对，终于可以跟宝石版通信了
接下来征服最后一个小岛吧
七之岛的上方是训练师之塔，可以锻炼自己的战斗水平和技巧
向下是溪谷入口，继续前进到七宝溪谷
谷中发现一处机关山洞
将七个洞穴填平，似乎触动了某处的机关
出洞继续向下，这里稍作休息，下面就是阿斯卡纳遗迹了
遗迹一共有七处，每个石室里都只有未知图腾
终于环游七岛结束了，回关都吧
来到华蓝市，图中洞穴看守人不见了，冲浪过去到华蓝洞（阴森啊）
从这里上去之后走下面的路直通（记住直通， 不要碎石走岔路）到楼梯口，下去
看到超梦没，绕路过去欺负它
大师球别舍不得用了，扔吧
番外篇第二章 石英再论剑
再次去挑战冠军联盟，天王门实力大增
科拿：
希巴：
菊子：
渡：
小茂：
