在通关口袋妖怪绿宝石一周目后，重新进入游戏，就来到了口袋妖怪系列的保留节目二周目模式，下面为大家带来绿宝石的二周目的图文攻略，二周目有好多新的神奇宝贝还有各种隐藏要素，包括大量必须要要二周目才能捕捉到的神兽，下面让我们一起来进行新的征程吧。

　　通关后出现在老家的楼上，下楼发现主角父亲来了

　　从主角父亲那里得到船票，可以在凯那市或水静市的游船上使用

　　主角父亲走后电视播出爆炸性新闻，说丰缘天空飞来了一只大鸟，玛玛让选大鸟的颜色，红色是拉帝亚斯，蓝色则是拉帝欧斯，之后可在丰缘的地图上随机遇见该宝可梦

　　一出门又被那父女两叫走，博士将宝可梦图鉴升级成为全国386模式

　　飞到凯那市做船前往水静市

　　在船舱内遇到亚希达，得知对战开拓区，需要下次乘船，在第二间房间休息一下就抵达水静市

　　原地在乘船，出现对战开拓区选项，GO

　　对战开拓区篇

　　从招待处获得开拓区通行证，房间内四人可详细咨询对战开拓区的各个设施

　　在对战金字塔下方遇到一棵很可疑的树，对其使用吼吼鲸洒水壶

　　不喜欢水的树立马攻了上来，原来是胡说说，话说你真的是伪装高手

　　没有树阻挡，可以顺瀑布而下来到一山洞前

　　洞内只有图图犬一种宝可梦

　　洞的另一头一直延伸到对战开拓区的北部

　　这间是亚希达的房子，话说也太小了吧

　　此处可进行宝可梦交换，玩家可用向尾喵换NPC的喵喵

　　这间房的两个老奶奶可以用BP换取技能

　　左边老奶奶：特别而又可爱

　　生蛋16BP

　　地球上投24BP

　　食梦24BP

　　百万吨拳击24BP

　　百万吨飞踢48BP

　　泰山压顶48BP

　　山崩地裂48BP

　　返拳48BP

　　电磁波48BP

　　剑舞48BP

　　右边老奶奶：强大而又漂亮

　　防卫卷16BP

　　打鼾24BP

　　泥汤24BP

　　高速星星24BP

　　冻风24BP

　　忍耐48BP

　　自我暗示48BP

　　急冻拳48BP

　　雷光掌48BP

　　火焰拳48BP